Es handelt sich um ein Hochgebirgsland: mehr als 70 % der Landesfläche wird von Hochgebirgen eingenommen, fast die Hälfte des Staatsgebietes liegen auf einer Höhe von 3.000 m und mehr. Der Osten des Landes wird vom Pamir-Gebirge und dem größten Teil des Pamir-Hochlandes geprägt, der im westlichen Teil stark vergletschert ist. Dort befindet sich der höchste Berg des Landes, der knapp 7.500 m hohe Pik Ismoil Somoni (früher Pik Kommunismus). Im Norden des Landes erstreckt sich die Gebirgskette des Alai. Nach Westen folgen die Gebirgsketten Turkestan und die Serawschan, südlich davon liegt das Hissargebirge. Nur der äußerste Norden des Landes ist von Tiefland geprägt: hier liegt das Ferghanatal, welches durch den größten Fluss des Landes – den Syrdarja – bewässert wird. Der größte See Tadschikistans ist der Kara-Kul im Osten des Landes. Tadschikistan befindet sich in der trockenen subtropischen Klimazone, das such durch ein kontinentales Klima mit kalten Wintern und heißen Sommern auszeichnet. Außer in den Tal- und Beckenlandschaften – wo ein subtropisches feuchtes Klima herrscht – werden in den Sommermonaten Temperaturen von bis zu 45°C erreicht. Es bestehen große Temperaturunterschiede zwischen den tiefer und den höher gelegenen Regionen des Landes. Die Jahresniederschlagsmengen sind relativ gering: bei der Vegetation handelt es sich um Steppenvegetation. Aufgrund der hohen Sommertemperaturen und der geringen Temperaturen in den Wintermonaten ist die beste Reisezeit im Frühling (April bis Juni) und Herbst (September bis November).